دبیرستان انرژی اتمی، وابسته به سازمان انرژی اتمی جمهوری اسلامی ایران در سال 1369 با هدف کسب ‏مدارج علمی همراه با نهادینه کردن فضایل اخلاقی در دانش‌آموزان در محیطی سرشار از آموزه‌های اخلاقی، ‏همراه با پتانسیل بالای علمی و برای پیشبرد اهداف نظام جمهوری اسلامی ایران تأسیس شد. ‏
 
  مأموریت سازمانی: ‏
‏1ـ ایجاد الگوی مناسب برای تغییر نگرش مدیریت در آموزش بخش متوسطه. ‏
‏2ـ تربیت دانشمندان و پژوهشگران آینده‌ی ایران اسلامی با سمت دهی انگیزه‌ها و آموزش‌های عمیق علوم پایه.
‏3ـ تعیین نگرش دینی و عرق ملی در بین دانش‌آموزان فرهیخته.
 
  چشم‌اندازها: ‏
‏* کسب جایگاه اول علمی در  عرصه داخلی و حضور برتر در المپیادهای کشوری.
‏* نمایشگاهی دائم جهت بازدید مدیران توسعه جو از سراسر کشور.
‏* سرمنشاء نوآوری‌های علمی و فرهنگی در سطح جهانی و کشوری  در مقطع متوسطه.
‏* گردآوری برترین کادر آموزشی و دانش‌آموزان شهر تهران در راستای یک هدف
‏* توجه بیشتر به یادگیری بجای یاددهی با روش‌هایی مانند «معلم پژوهنده» و «سازمان یادگیرنده»‏.
‏* هم راستا سازی اهداف آموزشی و فرهنگی در قلب و ذهن دانش‌آموزان با استفاده از هم افق‌سازی نگاه ‏دبیران، مربیان و مدیران. ‏
براساس همین اهداف و سیاست‌ها، مدیریت و کادر دبیرستان انرژی اتمی اعتقاد پیدا کرد که کسب مدارج ‏علمی در راستای دستیابی به اهداف مقدس جمهوری اسلامی ایران، بزرگ‌ترین جهاد علمی و جنبش نرم‌افزاری ‏است که مقام معظم رهبری همواره بر آن تأکید داشته‌اند. ‏
دبیرستان انرژی اتمی دانش‌آموزان را ارزشمندترین سرمایه حال و آینده کشور دانسته و برای آنان حداکثر تلاش ‏و کوشش مادی و معنوی را به کار بسته و با اعتقاد  و به کارگیری فن‌آوری و تکنولوژی روز بستری مناسب و ساختاری ‏جدید برای بهبود کیفیت آموزش فراهم آورده است. ‏
توجه به درخواست مردم، اهمیت دادن به استعدادهای فردی دانش‌آموزان، ایجاد کار گروهی و افزایش روح ‏سازمانی در بین دبیران و کادر آموزشی دبیرستان، صداقت، شفاف‌سازی، مردم داری و تلاش همراه با نوآوری ‏از دست‌آوردهای دبیرستان انرژی اتمی در 20 سال گذشته است.
‏